El Museo de Paleontología se encuentra ubicado en el edificio histórico que comparten la Academia Nacional de Ciencias y la Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, en la Manzana Jesuítica del casco histórico de Córdoba.

Se exhibe una enorme colección de fósiles, evidencias de seres vivos, plantas y animales, provenientes de las tres últimas eras geológicas. Son intervalos de tiempo que duran muchos millones de años, y que se diferencian principalmente por los tipos de animales que vivieron en ellas.

Existen diversas salas acondicionadas para que tanto niños como adultos puedan conocer las variadas evidencias de vida que incluyen huesos, dientes, caparazones, troncos, hojas, huevos, y huellas, fósiles provenientes de nuestro país, pero también fósiles de otros países del mundo, como Alemania, Brasil, China y Francia.

El Museo de Paleontología fue fundado en 1883, y su primer director fue el eminente paleontólogo argentino Florentino Ameghino.

Funcionaba solamente como repositorio científico y centro de investigación. En 1995, por disposición del Rector de la Universidad se restauraron dos amplios salones ubicados en el primer piso del edificio histórico de la Academia Nacional de Ciencias, abriéndose así una parte de su colección al público.